亞洲大學生醫系大師講座登場!

張貼者:2013年9月26日 上午6:25ASIA Asiau   [ 已更新 2013年9月26日 上午6:25 ]

2013-09-26

生醫系大師講座,邀請香港大學計算機科學系副教授姚兆明主講「宏觀基因組」(Metagenomics)。

 

圖說:香港大學計算機科學系姚兆明副教授至亞洲大學演說,以目前最新發展的「宏觀基因組」(Metagenomics)為核心,探討當前學術與實務之挑戰及相關領域中的發展性與應用性。

亞洲大學(Asia University, Taiwan)生物與醫學資訊學系9月23起,一連三天舉辦生物與醫學資訊學系大師講座,邀請香港大學計算機科學系副教授姚兆明以目前最新發展的「宏觀基因組」(Metagenomics)為主題,探討當前學術與實務之挑戰及相關領域中的發展性與應用性。

 

姚兆明副教授指出,在我們生活的環境中,如泥土、海水甚或至人體胃腸道裡,存在著上百千種的微生物;在過去,由於DNA定序的技術過於昂貴及速度太慢,只能針對單一物種的基因組研究,所以對於這些共生性的生物系統了解不多。 近年來,由於次世代定序(Next Generation Sequencing, NGS)的技術出現,使得定序的費用降低及速度提昇了許多,使得大量定序實驗得以進行,讓我們得以了解環境中複雜的微生物群相。

 

他強調,「宏觀基因組」的應用,在醫學上,我們可以藉此找出健康的人體共生菌群,或是篩檢出未知的致病菌;在能源問題及環境問題上,可以幫人類找到特殊菌群來生產生質能源,或是分解有毒物質;在農業上可以尋找適合植物生長的微生物,此外,在生物科技上、生態學上,「宏觀基因組」的研究都有很大的貢獻。

 

圖說:香港大學姚兆明副教授至亞洲大學演講。

然而,快速的實驗技術也因此累積了大量的資料;姚兆明副教授舉例說,從一個環境樣本中得出的基因序列資料容量可能就達1000 GB (Gigabyte)之多,為了處理這些各物種混合在一起的DNA小片段,就需借用資訊、統計學、資料採礦等的技術幫忙。「宏觀基因組」當前急需要解決的問題有:(一)如何推估原樣本中有幾種物種;(二)如何從定序出來的小片段重組樣本中所有物種的基因組;及(三)那些DNA小片段是屬相同的物種。

 

姚兆明副教授在第一天的演講中,先給了全面性的慨論。第二天的De novo assembling及第三天的Binning演講分別描述了如何解決上述的問題。

 

亞大生物與醫學資訊學系吳家樂教授擔任主持人,他說,透過此次大師講座的舉辦,讓學生了解現今世界生醫資訊研究及發展的脈動,藉以提升學生及教師國際視野及知識增長,也可提升亞大國際知名度,更希望透過國際學者與亞大師生互動,提升國際競爭力,增廣見聞,期能達到學術與實務的雙贏局勢。

圖說:香港大學姚兆明副教授(前排右二)會後與參與活動全體亞洲大學師生合照



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